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农学院关雪莹课题组报成功在植物中利用CUT&Tag进行染色质状态分析

编辑: 时间: 2020年09月04日 访问次数:177


  近期,农学院关雪莹课题组团队根据动物细胞中CUT&Tag的方法,以棉花为模型系统,发展了一套在植物中进行CUT&Tag的方法,为植物染色质状态的表观遗传研究提供了一个比ChIP更加优秀可行的方法。相关研究成果以“Efficient Chromatin Profiling of H3K4me3 Modification in Cotton Using CUT&Tag”为题发表在Plant Methods上。

研究提供了一种使用植物细胞核分离的方式改进的CUTTag方法,并建立了适用于异源四倍体基因组的生物信息分析工作流程。本研究方法也可以广泛用于其他组织和植物。研究结果表明,与ChIP-seq相比,CUTTag方法比常规ChIP的实验流程更快,并且显示了更高的分辨率,更低的背景信号和更好的重复性。该成果专门为植物细胞设计的优化的CUTTag方法具有广泛的植物表观遗传研究用途。

关雪莹教授陶晓园博士冯守礼博士赵汀博士共同参与了此项研究,该研究项目得到了国家青年基金面上项目和青年项目,国家重点研发计划七大农作物育种专项(子任务),中国博士后基金,大北农基金,中央高校基本科研业务费,江苏省协同创新中心的支持。

                                              (作物所供稿)


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